ÌÇĐÄÍűÒł°æ

26 april 2024

AI gör det möjligt att snabbt och noga identifiera vilket område som ska strålbehandlas vid behandling av cancertumörer. Men det råder brist på medicinska data att träna AI-modeller med. Försök pågår att träna dem med så kallade syntetiska medicinska bilder.

Bilden bestÀr av tvÄ delar: Fyra snittbilder av en hjÀrna pÄ ena sidan och fyra snittbilder av en annan hjÀrna pÄ andra sidan
En av dessa två bilder är riktig och en är syntetisk. Vilken tror du är syntetisk?*  

För att använda strålbehandling på en patient med en eller flera cancertumörer är det viktigt att veta exakt var tumörerna är lokaliserade. Cancerläkare, så kallade onkologer, behöver också ta hänsyn till riskorgan, vilket är vävnad som ligger i anslutning till tumören. Genom att precisera exakt område kan strålningen slå ut tumörvävnaden utan att skada viktig intilliggande vävnad. För att lokalisera tumör och riskorgan används en magnetkamera för att samla in olika typer av bilder. Inför strålterapi måste en strålonkolog ofta för hand rita ut tumören och riskorganen i dessa bilder, vilket kan ta timmar av onkologens tid per patient. Genom att i stället använda sig av artificiell intelligens, AI, kan alla områden bli utritade per automatik och därmed spara många timmar i sjukvården.

Viktigt med många bilder

AI-modellen lärs upp genom att träna på en stor mängd medicinska bilder, där strålonkologens utritningar används som facit. Det är viktigt att den stora mängden data som används representerar så stor andel av befolkningen som möjligt, för att modellerna ska kunna användas på alla patienter. Dock råder det brist på medicinska bilder och medicinsk information att träna upp AI med, eftersom det finns flera juridiska aspekter att ta hänsyn till. Det krävs bland annat etiskt godkännande när sådan känslig information ska delas för forskning.

Generera bilder för att få stor mängd bilder

I en artikel publicerad i tidskriften Scientific Data beskriver LiU-forskare hur de utvärderar metoden att istället generera bilder att träna AI-modeller med. Sådana bilder kallas syntetiska bilder.

– Syntetiska bilder kan vara lättare att dela med andra forskare. Eftersom sådana bilder inte hör till en specifik person är inte GDPR applicerbart, säger biträdande professor Anders Eklund.

PortrÀtt pÄ tre forskare
Biträdande professor Anders Eklund vid Institutionen för medicinsk teknik (IMT) och Institutionen för datavetenskap (IDA) undersöker tillsammans med postdoktor Muhammad Usman Akbar (IMT) möjligheten att generera så kallade syntetiska bilder att träna AI-modeller med. Neuroradiologen Ida Blystad har bedömt de syntetiska bilderna. Hon är också adjungerad universitetslektor vid Institutionen för hälsa, medicin och vård (HMV).

Forskarna skapade de syntetiska bilderna utifrån en öppen samling av data som kallas BraTS. BraTS innefattar bilder och utritade tumörer för hjärntumörpatienter från en mängd olika sjukhus. Eftersom bilderna bygger på öppen data har forskargruppen kunnat dela vidare de syntetiska på AIDA (Analytic Imaging Diagnostics Arena) data hub, så att andra forskare också kan använda dessa bilder.

Berzelius hjälpte dem att spara år av väntetid

Superdatorn Berzelius.
Superdatorn Berzelius, en av världens snabbaste datorer.Fotograf: Thor Balkhed
Anders Eklunds forskningsgrupp har stor hjälp av superdatorn Berzelius på Nationellt superdatorcentrum (NSC) vid Linköpings universitet. För att skapa och utvärdera syntetiska magnetkamerabilder på hjärntumörer har forskarna använt Berzelius effektivt. Skulle de istället använt en vanlig kraftfull dator skulle samma jobb tagit mer än fem år.

Forskargruppen jämför resultatet från AI-modeller tränade med syntetiskt framställda bilder med resultatet från AI-modeller tränade med riktiga magnetkamerabilder på patienters hjärntumörer.

– En utmaning som kvarstår är om vi har för få ursprungliga medicinska bilder för att träna modeller att generera syntetiska bilder. Vi har sett att de syntetiska bilderna i dessa fall kan bli för lika de riktiga bilderna och sådana bilder vill man inte dela, säger Anders Eklund.

Positivt resultat

Det återstår också att reda ut de exakta juridiska villkoren för att kunna dela syntetiska bilder. I övrigt är resultaten goda. De visar att syntetiska medicinska bilder kan vara ett alternativ för att enklare kunna dela data och därmed utveckla AI-modeller med medicinsk tillämpning.

*Rätt svar på bildfrågan i översta bilden finns i figur 5 i

Om projektet

Forskningsprojektet ASSIST

BitrĂ€dande professor Anders Eklund vid Institutionen för medicinsk teknik (IMT) och Institutionen för datavetenskap (IDA) driver forskningsprojektet ASSIST tillsammans med bitrĂ€dande professor Evren Özarslan (IMT). Tillsammans med postdoktor Muhammad Usman Akbar (IMT) undersöker Anders Eklund möjligheten att generera sĂ„ kallade syntetiska bilder att trĂ€na AI-modeller med.

UtvĂ€rderingen av de syntetiska bilderna har skett i samarbete med företaget Eigenvision och Region Östergötland. Samarbetet underlĂ€ttas av CMIV, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, dĂ€r bland annat lĂ€kare och ingenjörer forskar tvĂ€rvetenskapligt. Neuroradiologen Ida Blystad har bedömt de syntetiska bilderna.

Kontakt

Forskningsverksamhet

Mer om artificiell intelligens vid LiU

Senaste nytt från LiU

En grupp mÀnniskor som sitter vid ett bord framför en folkmassa.

Deltagare i FN:s klimatmöten vill se större fokus på genomförande

FN:s klimatförhandlingar kritiseras ofta för att gå för långsamt. En ny studie undersöker vilka förändringar delegater och deltagare vid klimatmötet COP29 vill se. Resultaten visar ett starkt stöd för bättre uppföljning av ländernas klimatåtaganden.

Studenter sitter vid bord med datorer i biblioteket.

Rekordstort intresse för Linköpings universitet när antagningen är klar

Linköpings universitet fortsätter att vara ett av Sveriges populäraste lärosäten. Över 52 600 personer sökte till höstens program och fristående kurser. Av dem har 19 250 personer nu  fått positiva besked.

Neil Lagali vid utrustning för att undersöka ögonen.

Ögonproblem efter covid-19 kan nu förklaras

Mild covid-19 kan ge svåra och långvariga ögonproblem, visar en studie från Linköpings universitet. Studien förklarar också varför det har varit svårt för drabbade att få hjälp. Avvikelserna upptäcks nämligen inte med standardmetoder.