Digital patologi, djupinlärning och bukspottkörtelcancer
När en tumör opereras ut från en patient, kan denna studeras med mikrosopi. Idag scannas mikroskopiglasen in, vilket möjliggör mer avancerade analyser. Histologin är ett fantastiskt verktyg att använda, där den (tidigare) levande vävnaden har fångats i en ögonblicksbild. Tack vare detta kan tumörer visualiseras i kontexten av den omgivande vävnaden, vilket kan hjälpa oss att förstå hur tumören kan avancera genom bukspottkörteln. Detta tydliggör vilka tumöregenskaper som kan vara användbara i kliniskt syfte.
I det nuvarande projektet utvecklar och använder vi en djupinlärningsplattform för att segmentera (identifiera) olika vävnadskomponenter inom bukspottkörtelcancer. Projektet stöttas av Wallenberg Centrum för Molekylärmedicin's postdoc-progam.
Bakgrund
Jag började min utbildning på Linköpings Universitet, där jag tog examen från Kandidatprogrammet i Medicinsk Biologi följt av Masterprogrammet Experimental and Medical Biosciences. Parallellt med mina studier hade jag förmånen att jobba extra på Klinisk Patologi, där jag förankrade min kunskap om flödet inom diagnostiken.
Under min tid som doktorand vid Karolinska Institutet fördjupades mitt intresse för bukspottkörteln, både vad gäller dess normala funktion, och vad som händer när en tumör växer där. Jag var handledd av Dr. Med. Marco Gerling och hade mycket stöd och upplärning av en av mina bihandledare, Dr. Med. Carlos Fernández Moro. Här studerade jag studerade hur tumörer i bukspottkörteln sprider sig inom organet. Bland annat blev det tydligt att beroende på vilken tumörsort det gäller, så bibehålls den omkringliggande, icke-maligna vävnaden väldigt olika skick.
Nu fortsätter jag min forskning inom digital patologi och bukspottkörtelcancer som postdok handledd av Dr, Docent Linda Bojmar och Dr.Med. Hakon Blomstrand.
